Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms