Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Exosc7Q9D0M0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms