Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zbed3Q9D0L1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms