Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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