Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis18aQ9CZJ6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms