Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms