Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Commd8Q9CZG3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd8Q9CZG3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Commd8Q9CZG3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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