Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nde1Q9CZA6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms