Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms