Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms