Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sgo1Q9CXH7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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