Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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