Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc17Q9CXD9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc17Q9CXD9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms