Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms