Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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