Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx28Q9CWT6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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