Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26657Q9CVR1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26657Q9CVR1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms