Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp13a2Q9CTG6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms