Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tma16Q9CR02 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tma16Q9CR02 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms