Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms