Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm16286Q9CQX6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16286Q9CQX6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms