Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otub2Q9CQX0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otub2Q9CQX0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms