Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms