Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed6Q9CQG0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms