Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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