Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rab5aQ9CQD1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms