Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpsQ9CQC2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpsQ9CQC2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms