Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp2Q9CQ73 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms