Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg3Q9CPX6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg3Q9CPX6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms