Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Bhlhe41Q99PV5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms