Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms