Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl1Q99N96 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms