Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp26Q99MX1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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