Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms