Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1b4Q99ME6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms