Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms