Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pagr1aQ99L02 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms