Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ciao1Q99KN2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms