Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TrabdQ99JY4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms