Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GatbQ99JT1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GatbQ99JT1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms