Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms