Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms