Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NelfcdQ922L6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NelfcdQ922L6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfcdQ922L6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms