Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mthfd1Q922D8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms