Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atl3Q91YH5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms