Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac11Q91WA3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms