Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms