Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsx1Q91V10 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms