Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms