Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul7Q8VE73 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul7Q8VE73 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms